L'action se déroule principalement au palais de justice de Paris. Le juge Nadia Lintz est chargée des affaires criminelles en étroite collaboration avec le commandant Gabriel Rovère. Les personnages de cette série sont inspirés du roman Les Orpailleurs de Thierry Jonquet.

L’élection comme présidente de Suzanne Fontana, non issue du sérail, au sein d’une des plus grandes et des plus influentes agences internationales de la planète coïncide avec l’enlèvement, au Yémen, d’un jeune délégué et d’une dizaine de collaborateurs de l’agence. "Cellule de crise" raconte dans un monde de communication et de faux-semblants, comment, pour ramener ses otages vivants, une idéaliste de l’humanitaire va devoir se salir les mains, nouer des alliances contre nature et remettre en cause tout ce en quoi elle croyait jusqu’alors.