Après avoir sauvé la vie du président des États-Unis, deux agents du FBI sont nommés à un nouveau poste baptisé « Warehouse 13 », un service qui abrite les objets surnaturels que le gouvernement américain a collectés à travers les siècles. Le duo se voit confier la mission de récupérer d'éventuels nouveaux artefacts susceptibles de mettre en danger des individus.
Matt Shade, un ancien joueur professionnel de hockey, décide de changer son quotidien en s'associant avec la détective privée Angie Everett pour résoudre de mystérieuses investigations. Grâce à leur nouvelle collaboration, Shade est forcé de remettre en question la personne qu'il est devenu et celle qu'il souhaite être.