Six mois après l'invasion de la Terre par des extraterrestres, la planète est en ruine et les survivants humains tentent de faire face. Les résistants s'organisent pour combattre les forces ennemies. Tom Mason, un ancien professeur d'histoire, se retrouve propulsé en tant que commandant en second du 2ème Régiment du Massachusetts. Si le but des survivants est d'essayer de subsister, certains d'entre eux vont également essayer de comprendre la raison de cette invasion.
Les deux jumeaux Zack et Cody sont un jour approchés par un scientifique qui leur propose de participer au "Projet Gemo": une série d’expériences dédiées aux liens qui unissent les jumeaux. Mais à l'issue du projet, les deux frères se rendent compte qu'ils partagent désormais les mêmes pensées, les mêmes sentiments et les mêmes sensations.