L'astronaute Brent est envoyé au secours de Taylor, mais s'écrase à son tour sur la "planète des singes". Cherchant à retrouver son compagnon avec l'aide de Nova, il suit sa trace jusque dans la "zone interdite" où il découvre une société de mutants humains télépathes.

En 1990, les animaux domestiques et le personnel de service ont disparu au profit des singes-esclaves. Mais ces derniers se révoltent et prennent le pouvoir, sous l'impulsion de Caesar, le fils de Cornélius et Zira...

Huckleberry Finn est un garçon de 15 ans qui entretient depuis longtemps une relation difficile avec son père, souvent violent. Lorsque son père tente de le kidnapper, Huck décide de s'enfuir de chez lui et quitte la ville sur un radeau. Huck est bientôt rejoint par Jim, un esclave en fuite qui n'est pas plus impatient de voir son maître que Huck ne l'est de voir son père. Alors que les deux amis descendent le Mississippi, ils sont confrontés à de nombreux défis et aventures.

L'agent spécial du FBI Olivia Dunham, le scientifique Walter Bishop, brillant mais anciennement interné, et son fils Peter, intrigant et réticent, découvrent un mystère mortel impliquant une série d'événements incroyables et réalisent qu'ils font peut-être partie d'un projet plus vaste et plus inquiétant qui brouille la frontière entre science-fiction et technologie.