Larry Robert, un chirurgien esthétique renommé, est bizarrement sollicité par trois jeunes mannequins ravissantes, désirant la perfection en matière de beauté. Une fois sa tâche accomplie, le médecin apprend que ces jeunes femmes sont mortes peu de temps après l'opération, dans de mystérieuses circonstances. Suspecté rapidement par la police, Larry, innocent dans cette affaire, veut à tout prix connaître le fin mot de cette histoire et laver son honneur.
New York, XXIIIème siècle. Une boule de feu fonce sur la Terre. Pour l'arrêter il faut retrouver le Cinquième Élément, l'être suprême, qui associé aux quatre éléments vitaux - l'air, l'eau, le feu et la terre - peut seul repousser Le Mal. Cornélius reçoit l'aide de Korben, taxi et ancien agent secret, et de Leeloo, extraterrestre qui a pris la forme d'une jeune femme aux cheveux oranges.
En vacances avec leurs enfants dans le désert du Mojave, au Sud de la Californie, Jim et Pat Henley prend un raccourci et se retrouvent bientôt dans une ville fantôme, que la population semble avoir désertée depuis de longues années déjà. Bloqués sur place, les Henley ignorent que la situation va tourner au cauchemar...