Alors que Kirsty a assisté aux monstrueux assassinats de son père et de sa belle-mère par les Cénobites elle est placée en centre psychiatrique, l'institut Channard. Mais apparemment son docteur, qui n'est autre que le directeur de l'institut, semble connaître le secret de la boîte. Il va alors ressusciter la belle-mère de Kirsty et tenter d'ouvrir la boîte à l'aide de Tiffany, une jeune autiste, spécialisé dans la reconstitution des puzzles. Mais quand la boîte s'ouvre, elle plonge les protagonistes dans le monde de Léviathan...
Un scientifique a créé un virus capable de contrôler le comportement des personnes infectées. Le scientifique, aidé par un agent de la CIA corrompu, s'empare d'un sous-marin nucléaire et tente de vendre le virus au plus offrant. L'agent Chris Cody est alors envoyé en mission afin d'arrêter le scientifique. Mais une fois à bord lui et son équipe s'apperçoivent que tout l'équipage du sous-marin est infecté par le virus.
L'agent Painter, membre des forces spéciales, est envoyé en mission en Tchétchénie. Il doit y empêcher la destruction d'une centrale nucléaire par les terroristes et localiser le point de frappe pour les missiles américains. Quand il se rend compte que l'ennemi n'est pas celui qu'il croit, Painter n'a pas beaucoup de temps pour éviter la catastrophe.
Pendant la première guerre mondiale, Lee Duncan, un soldat de l'armée américaine, découvre un chiot dans les décombres d'un bâtiment bombardé. Baptisé Rintintin, l'animal ne fait pas l'unanimité sur le campement militaire et le capitaine Sandman ordonne à Duncan de le dresser ou de s'en débarrasser. Peu à peu accepté, il deviendra vite nécessaire et certains, dans la fureur des combats, lui devront même la vie.
Inquiet pour la santé de sa fille autiste, un père décide de la retirer de l'hôpital où elle est suivie. Mais au moment de l'évasion une panne d'ascenseur les empêchent de partir. Quand les portes s'ouvrent de nouveau, l'hôpital semble désert, mais des corps mutilés sont rapidement trouvés et des créatures d'un autre monde font leurs apparitions. La fillette semble être le seul moyen de survie du groupe.
A la fin des années 70, lorsqu'un escadron de chasseurs MIG 23 abat un objet non identifié, les débris sont envoyés dans une zone ultra secrète de la Tussier. Des chercheurs vont essayer de comprendre ce à quoi ils sont confrontés.Une trentaine d'années plus tard, l'Union Soviétique n'existe plus mais les informations se sont échappées un peu partout dans le monde de manière officieuse. Le résultat, c'est la destruction d'une petite ville de l'Iowa puis une autre dans la l'est de la Russie...